Mulder tenta di liberare Scully dopo che è stata rapita da un uomo con problemi mentali che crede negli UFO.

Riassunto:
      Mulder corre a casa di Scully quando capisce che lei è stata attaccata da Duane Barry. Quando arriva sulla scena, si sta già svolgendo un'indagine della polizia. Ci sono tracce di lotta; vetri rotti e delle macchie di sangue umano sul pavimento. La madre di Scully, Margaret parla con Mulder del rapimento; gli parla di un incubo che ha avuto il quale ha anticipato l'incidente. Gli agenti dell'FBI sono scettici quando Mulder suggerisce che la storia di Barry sugli UFO potrebbe essere vera. Skinner rimuove Mulder dal caso e lo manda a casa.
      Nel frattempo, Barry si dirige verso il luogo dove atterrano gli alieni. Un poliziotto ferma Barry per eccesso di velocità. Notando il sangue sulle mani di Barry estrae l'arma di ordinanza. Ma Barry lo anticipa uccidendolo. Mulder guarda una registrazione dell'incidente che è stata registrata da una telecamera montata all'interno della macchina di pattuglia del poliziotto. Usando lo zoom del video, si riesce a vedere l'immagine di Scully - è viva.
      Mulder riascolta la registrazione audio della negoziazione degli ostaggi. Comprende che Barry parlava di Skyland Montain in Virginia. Accompagnato da Krycek, Mulder va alla remota località. Vengono a sapere dall'operatore della teleferica che Barry sta andando sulla montagna usando strade secondarie. Sperando di raggiungere Barry sulla sommità, Mulder sale sulla teleferica ancora insicura e va verso la montagna. Ma prima che la cabina riesca ad arrivare a destinazione, Krycek uccide l'operatore e sabota i controlli, fermando Mulder. Quando Mulder tenta arrampicarsi fuori dalla cabina, Krycek ridà energia, sperando di farlo cadere. Ma Mulder riesce a salvarsi e continua la sua ricerca.
      Mulder vede una luce accecante passargli sopra. Quando localizza Barry, Scully si trva da nessuna parte. Barry comincia a ridere in maniera isterica. Egli dice che gli alieni non gli daranno più fastidi perché ora hanno un'altra cavia. Ma Mulder rimane scettico; interroga la sanità mentale di Barry e lo colpisce durante l'interrogatorio. Poco dopo che Krycek lo ha interrogato di persona, Barry muore per un arresto cardiaco.
      Mulder dice a Skinner che Krycek ha avvelenato Barry - e che i militari sanno dove si trova Scully. Crede che Scully sia andata molto vicino alla verità, specialmente quando ha scoperto i pezzi di metallo nel corpo di Barry. Mulder conclude che un'operazione militare segreta - assistita dall'Uomo che Fuma - sta dietro al rapimento. I sospetti vengono confermati quando Krycek svanisce senza lasciare traccia. Rimasto con un'unica possibilità, Skinner ufficialmente riapre gli X-Files.