I.I.S.S. Altamura - Istituto Tecnico per Geometri "Nervi" - Istituto Tecnico Industriale "Galilei"

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"Glutaminil t RNA sintetasi"

Introduzione – Questo script mostra la struttura della glutaminil tRNA sintetasi dell’ E.coli, una proteina che si lega fortemente alla struttura dell’ RNA. Scorrere in giù il testo finchè è visibile la figura.(Basato sul file 1gts. pdb, Perona et a., Biochemistry 32, 8758 (1993)).

Ecco il complesso con la proteina in cartoons e l’RNA in wireframe. Si noti l’interfaccia estesa fra il tRNA e la proteina. Poichè i legami idrogeno delle basi sono usati per formare la struttura secondaria del tRNA, le interazioni fra il tRNA e la proteina sono abbastanza simili a quelle tra il DNA e le proteine, facendo affidamento sugli idrogeni extra che legano i gruppi all’estremità delle basi e sulle interazioni elettrostatiche con lo scheletro.

In questa visuale la dimensione dell’interfaccia della proteina tRNA è meglio vista.

La funzione dell’enzima è quella di addizionare un ammino acido all’adenina finale del tRNA. Si noti come questa base è nascosta nella zona attiva dell’enzima, mentre la maggior parte del tRNA rimanente è contenuto in superficie.

Ecco un’altra visuale dell’accettore - adenina