Qui viene visualizzato un dipeptide formato da un'alanina ed una serina allo scopo di visualizzare il legame peptidico (o ammidico).
Si noto la struttura planare del legame che assumendo un grado di 40% di doppio legame conferisce una rigidità alla struttura complessiva. Questa rigidità non si ha invece attorno ai legami dei gruppi laterali che possono ruotare secondo due angoli Phi e Psi, i cui rispettivi valori possibili influenzano la struttura secondaria della proteina.