Qui di seguito viene visualizzato il legame peptidico per una alfa elica, con gli angoli phi e psi opportuni. Si manipoli la molecola per rendersi conto degli angoli di legame. Si clicchi qui per visualizzare i due legami attorno a cui ruotano gli angoli psi e phi.


Questa è la struttura di una proteina che è stata progettata con gli amminoacidi opportuni. Per visualizzare i legami ad Idrogeno (in verde) si clicchi sul pulsante. Si noti come il legame ad H si instauri tra il gruppo C=O di un amminoacido e l'H del gruppo N-H del 5° amminoacido successivo, ogni 4 amminoacidi. Ci sono 3,6 residui per giro. I legami ad H si può notare che sono allineati all'asse dell'elica. La striscia gialla indica la sequenza dei legami peptidici.
Si ruoti la molecola per poterla vedere dall'alto. Si noterà come tutti i resui delle catene laterali si dispongano in maniera radiale stando così il più distante possibile l'un dall'altro.