Ritornando sulla scena della loro prima indagine di sette anni prima, Mulder e Scully incontrano un UFO che può far terminare la loro collaborazione.

Riassunto:
      Una macchina della polizia corre su una strada di Bellefleur, Oregon. Sul sedile del conducente c'è il detective Miles (precedentemente visto nell'episodio "Pilot \ Al di la del tempo e dello spazio"), che tenta di comunicare via radio con il suo vice, Ray Hoese, mentre si avvicina con cautela al luogo di un incidente aereo nei boschi. Improvvisamente, l'orologio digitale va all'indietro indietro. La macchina perde potenza mentre va a scontrarsi contro un'altra auto di pattuglia, parcheggiata sul lato della strada. Un detective Miles stordito e ferito riesce ad uscire dalla sua auto. Un grande incendio arde in lontananza attraverso gli alberi. Nota che le lancette del suo orologio da polso ruotano all'indietro, mentre si avvicina all'altro veicolo. Un Ray Hoese privo di sensi è accasciato sopra il volante. Gli occhi del vice sono gonfi, le palpebre e le membrane sono piene di vesciche e di bruciature. Il detective Miles guarda verso il basso vedendo di aver messo il piede su una ribollente sostanza verde. Quando si guarda attorno vede un'altro vicesceriffo Hoese che sta in piedi davanti a lui. Gli occhi degli dell'uomo sono illesi. Questo Hoese ha tre buchi di pallottole nel suo torace con la stessa sostanza verde che ne esce. Miles balza indietro spaventato.
      A Washington Mulder siede davanti ad un gran numero di ricevute. L'agente Chesty Short, il capo revisore dell'FBI, ammonisce sia Mulder che Scully per le stravaganti spese accumulate a causa degli X-files. Li interroga sulle indagini future, ora che il caso di Samantha è stato risolto. Tornati nel loro ufficio, gli agenti ricevono una telefonata da Billy Miles (vedi l'episodio "Pilot \ Al di la del tempo e dello spazio"), che li informa di nuovi rapimenti. Questa volta, però, non lo vedono protagonista.
      Due adolescenti setacciano la foresta dell'Oregon in una eccitata ricerca dell'UFO. Uno dei ragazzi fa un passo in un campo di forza invisibile e viene scosso ad una elevata velocità. Spaventato da questa improvvisa scomparsa, il suo amico Richie lascia cadere la sua pila, che intanto è diventa improvvisamente incandescente, e fugge nei boschi.
      Marita Covarrubias fa rilasciare Krycek da una prigione Tunisina su ordine dell'Uomo che Fuma. I due trovano l'Uomo che fuma vicino alla morte e si di una sedia a rotelle, assistito da un'infermiera. Krycek è furioso con l'anziano uomo per averlo fatto incarcerare in una prigione straniera. L'Uomo che Fuma è ansioso di comunicargli che una nave aliena è entrata in collisione con un aereo militare in Oregon. E lui ha bisogno che loro la recuperino. "La nostra chance di ricostruire il progetto," bisbiglia con una fievole voce spremuta attraverso un foro nella gola.
      A causa del rimprovero dell'agente Short e per non spendere ulteriori soldi soldi dell'FBI, Mulder e Scully decidono di recarsi in Oregon ad incontrarsi con Billy Miles, che ora è un vicesceriffo, a loro spese. La navicella non identificata non è stata ancora trovata, ed il vicesceriffo Hoese ancora disperso. Il padre di Billy, il detective Miles, afferma che là non c'era nessun altro velivolo. Gli agenti seguono gli ufficiali Miles sulla scena. Nel punto in cui l'auto del detective Miles si è spenta, Mulder vede una "X" dipinta sulla strada. È lo stesso segno che Mulder ha fatto sulla strada sette anni prima per segnalare il punto in cui si verificava un anomalo disturbo elettrico. Scully localizza dei bossoli sul terreno espulsi dall'arma di Hoese, ma non c'è alcuna indicazione di quello che sarebbe potuto essere il bersaglio. Gli agenti se ne vanno, e il detective Miles mette la busta con le prove nel bagagliaio -- accanto al corpo di Miles. Mulder e Scully vanno a far visita alla moglie di Hoese, Teresa, e rimangono sorpresi nel scoprire che è una vittima dei rapimenti che li hanno avvicinati sette anni prima. Dice che suo marito è anche lui una vittima dei rapimenti e che è stato rapito e sottoposto a test molte volte. Mentre Scully tiene il bambino di Teresa, Mulder guarda la suo partner. La vista di Scully con un bambino sembra avere un effetto su di lui.
      Più tardi quella stessa sera, Scully, pallida e sudata, va nella camera di Mulder presso il motel, lamentando di sentire freddo. Lui la mette sotto le coperte e gli si corica accanto abbracciandola per scaldarla. "Non ne vale la pena, Scully," dice. Ritiene infatti che il costo personale sia troppo elevato quando la può privare della maternità e della salute. Si chiede se non siano arrivati ad una fine. Fuori dal motel, Krycek siede all'interno di un'auto parcheggiata. E' al telefono con l'Uomo che Fuma, a cui riferisce che nessuno riesce a trovare la nave spaziale, mentre Mulder e Scully cercano il vicesceriffo. L'uomo che Fuma lo assicura che la nave è proprio là. Se troverà il vicesceriffo troverà la nave. L'Uomo che Fuma termina la conversazione Krycek, e Marita gli chiede perchè sta giocando al gatto e al topo. "La nave si sta autoriparando," afferma l'Uomo che Fuma. L'Uomo che Fuma resta convinto che il suo tirapiedi avrà successo, ma è dubbioso sulle vere intenzioni di Krycek una volta trovata la nave. Dall'altra parte della città Teresa Hoese viene svegliata dal ritorno del marito disperso. Quando Ray non le risponde, comprende che è solo un impostore. Lo ferisce con un paio di forbici, ma le pugnalate non lo danneggiano. Del liquido verde ribollente esce dalle ferite sul torace e provoca delle vesciche e delle bruciature agli occhi di Teresa. Inciampa e viene afferrata dall'impostore.
      La mattina seguente, Billy comunica a Mulder e Scully che Teresa è sparita. Immediatamente riconoscono una bruciatura sul pavimento dovuta all'acido verde, e Scully mentre è chinata per toccarlo, viene colta da un'altra vertigine. Fuori dalla casa degli Hoese, Mulder e Blly notano Richie che osserva la scena del crimine. Richie ammette che "loro" hanno preso il suo amico, e che il detective Miles conosce cosa sta accadendo perché era là. Richie conduce gli agenti all'area della foresta dove il suo amico è svanito. Scully viene sorpresa da rapida scossa dovuta ad un campo di forza che la scuote ad una elevata frequenza. Notando che Scully è scomparsa, Mulder la chiama. Lei giace a terra semicosciente, come se fosse stata colta da un'altra vertigine. Mentre Mulder culla la testa della sua partner, Scully si chiede perchè le sta accadendo questo. Mulder comprende che questi non sono solamente dei rapimenti casuali, ma che chi viene rapito non tornerà. Un Billy diffidente ritorna casa ed estrae la propria arma verso l'uomo che sembra essere suo padre. "Non so chi sei, ma non mi prenderai," escalama. Il detective Miles calma suo figlio prima di trasformarsi nel Cacciatore di Taglie alieno. Nello stesso momento Mulder e Scully entrano nella per avvertire Billy. Entrambi gli uomini sono svaniti.
      Due giorni dopo Mulder siede nel suo presso l'FBI, quando Skinner entra con Krycek e Marita. C'è un momento di completa sorpresa, ma Mulder si alza rapidamente dalla sedia per attaccare la sua nemesi. Gli spiegano che l'Uomo che Fuma sta morendo, ma il suo ultimo desiderio è di ripristinare la cospirazione. Mentre il Cacciatore di Taglie elimina le prove degli esami sui rapiti, la nave spaziale, coperta da un mantello in energia, si sta ricostruendo. Quella sera, i Guerrieri Solitari vengono condotti nell'ufficio di Skinner per un consulto. Determinano l'ubicazione della nave sebbene i militari non siano stati in grado di determinarla con l'aiuto dei satelliti. Mulder ascolta sospettosamente Krycek e Marita in silenzio. Scully improvvisamente lascia la stanza e Mulder la segue nell'atrio. Da quando sono ricominciati i rapimenti, lui rifiuta di permetterle di tornare in Oregon. "Non rischierò di perderti, Scully," dice. Lei lo abbraccia, dicendogli che non lo lascerà andare da solo.
      Scully rimane a Washington con i Guerrieri Solitari, esaminando i rapporti dei rapiti. Ognuno di loro ha manifestato la stessa irregolare attività cerebrale che è stata riscontrata in Mulder precedentemente quell'anno. Conclude che Mulder è in reale pericolo di essere rapito. Senza preavviso Scully sviene, ed i Guerrieri Solitari corrono a soccorrerla. Nel frattempo, Mulder e Skinner entrano nella foresta dell'Oregon. Posano una serie di puntatori laser per scoprire dei movimenti anormali. Mentre Mulder segue i raggi dei laser, qualccosa cattura la sua attenzione. Le linee rosse vengono deflette e formano in maniera grossolana una una cupola, ma sembra come che si scontrino con un campo di energia. Mulder allunga una mano per toccare il campo e questa comincia a vibrare ad elevata velocità. Alzando lo sguardo dopo aver posato l'ultimo puntatore laser, Skinner si accorge che Mulder è sparito. All'interno del campo, un cono di luce brillante si riflette su Mulder. La sua espressione è colma di timore reverenziale. Gli altri rapiti sono là ad accoglierlo con un sorriso sorride. Una nave spaziale si libra in alto, ed il Cacciatore di Taglie entra nel cerchio di dei rapiti. La luce cresce di intensità e l'espressione di Mulder di timore reverenziale si trasforma in paura. Fuori dal campo di forza, Skinner è inconsapevole di questa attività e chiama Mulder. All'improvviso, un nave spaziale appare dal nulla e Skinner la guarda salire nel cielo serale. E' rimasto solo nell'oscurità.
      Krycek ritorna dall'Uomo che Fuma affermando di aver fallito la missione, ma l'Uomo che Fuma gli dice che forse Krycek non mai ha voluto che riesca. Mentre Marita guarda, Krycek spinge la sedia dell'Uomo che Fuma giù per la scala. Il corpo dell'Uomo che Fuma giace a terra, immobile ed apparentemente morto.
      La mattina successiva, Skinner appare goffo mentre fa visita a Scully nella sua stanza d'ospedale. Lei stà meglio, ma attende la risposta di altre analisi. Skinner cerca di trattenere la sua emozione mentre le dice di aver perso Mulder. Lei gli prende la mano e gli dice di aver già avuto la notizia. "Cio che ho visto non lo posso negare," promette. Cominciano entrambi a piangere, e Scully gli assicura che trovera il suo compagno. "C'è qualche cosa altro," dice a Skinner. Sebbene non riesca a spiegarlo o crederci lei stessa, sta aspettando un figlio.
      Continua ...