I.I.S.S. Altamura - Istituto Tecnico per Geometri "Nervi" - Istituto Tecnico Industriale "Galilei"

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Cinetica Enzimatica

Michaelis Menten

La regolazione

I meccanismi

Le energie

Cinetica a Paysley

I meccanismi a Paysley

"La cinetica di Michaelis Menten"

Il meccanismo enzimatico più semplice è costituito dei seguenti due stadi.

e la velocità di reazione è

Per poter derivare un'equazione utile che descriva questa reazione si fa l'assuzione che la reazione proceda attraverso uno stato stazionario per cui durante quasi tutta la reazione [ES] è piccola e non cambi, d[ES]/dt=0 .

Con queste assunzioni si ricava l'equazione di Michaelis Menten.

Grafico di Michaelis Menten

L'equazione di Michalis Menten è un'eiperbole equilatera e l'enzima viene caratterizzato da due costanti

Km, cioè la concentrazione del substrato per cui v è metà della Vmax. Vmax, la velocità massimale della reazione che si ha quando [S]>>Km. Per la determinazione dei valori di Km e Vmax ci sono vari metodi di trasformazione. Uno dei più famosi è il grafico dei doppi reciproci o di Lineweaver Burk, per cui

velocity.gif (4203 bytes)linburk.gif (4515 bytes)

Numero di Turnover

Il numero di turnover di un enzima, kcat, è la velocità massimale per molecola di enzima per unità di prodotto.

L'efficienza enzimatica

Rielaboando l'equazione della velocità si ha

Quando [S] << KM, allora kcat/KM è una costante di velocità del secondo ordine ed è una misura dell'efficienza dell'enzima a basse [S]. Quando kcat/KM  è 108-109 la reazaione è controllata dalla diffusione.

Enzima
Substrato
kcat (sec-1)
KM(M)
kcat/ KM (M-1) (sec-1)

Catalasi

H2O2

4.0x107
1.1
4.0x107

Anidrasi Carbonica

CO2

1.0x104
1.2x10-2
8.3x107

Acetylcholine esterase

Aceticolina

1.4x104
9.0x10-5
1.6x108

Fumarasi

Fumarato

8.0x102
5.0x10-6
1.6x108

Per substrati differenti kcat/KM è anche il miglior modo per determinare la specificità di un enzima.

Nell'idrolisi di un legame peptidico per mezzo della chimotripsina è critica la natura della catena laterale R1 come si evince dalla seguente tabella, dove si nota che il migliore è la fenilalanina

R1

kcat/ KM (M-1sec-1)

Gly

1.3x10-1

Val

3.6x102

Leu

3.0x103

Phe

1.0x105