L'aristotelismo sempre più radicale della medicina scientifica, culminante con l'introduzione nel curriculum del Canone di Avicenna, influenzerà attivamente le altre discipline universitarie, compresa la teologia.
La "rivoluzione scientifica della medicina", pur iniziando in Francia, ha
la sua sede principale nella Scuola Salernitana,
dove si commentano i nuovi testi tradotti da
Costantino Africano e si gettano le basi per
fissare un curriculum di studio dello studente. Inoltre, con le
Costitutiones Melfitanae emanate da Federico II si ha il primo esempio
di obbligo di un esame abilitazione per l' esercizio della professione
medica.
Il lavoro di traduzione continua incessante: Gherardo da Cremona, Burgundio
da Pisa e altri traduttori completano la traduzione dall'arabo del corpus
testuale medico, mentre nella seconda metà del XIII secolo Nicolò
da Reggio fornirà l'Occidente di nuove traduzioni direttamente dal
greco. Si aprono nuove sedi universitarie dove si insegna la medicina: dopo
Montpellier, Parigi e Salerno, è la volta, in Italia, di Padova,
Bologna, Pisa, Siena, Napoli.
La "rivoluzione scientifica" non migliorò la pratica della medicina, che invece venne appesantita da un bagaglio teorico splesso complesso e talora inapplicabile: la nascita delle Scuole, con buona pace di molti storici della medicina, non fu un progresso, ma sostanzialmente un'involuzione della medicina altomedievale.