Le proteine hanno un numero limitato di motivi strutturali.

Questo è un motivo comune: elica gomito elica.

Questo motivo è denominato EF Handed e rappresenta il motivo del legante del calcio in molte proteine Calcio leganti (basata su 5CPV.pdb, Swain, Kretsinger & Amma J. Biol. Chem 264 16620 (1989)). Il Calcio ione è legato da due residui di Asparagina e uno diglucina.

Questo è un motivo beta a piega a forcina, con le due beta a pieghe del tipo antiparallelo.

Questo è un motivo beta alfa beta con le beta parallele.