Mario
Milani
... mi occupo di
struttura di proteine; attualmente lavoro presso il dip. di Bioscienze
dell'Universita' di Milano e tengo il corso di Biofisica
presso il Dip. di Fisica
curriculum
vitae (25/06/2014)
publications
1.
Amminoacidi: caratteristiche chimiche. Proteine,
classificazione
strutturale: struttura primaria, elementi di
struttura secondaria,
motivi, domini, struttura terziaria, strutture quaternarie.
(
introduzione.pdf,
amminoacidi.pdf,
legame_peptidico.pdf, strutture_alpha.pdf,
strutture_beta.pdf,
motivi.pdf,
domini.pdf)
2.
Interazioni non covalenti (int_non_covalenti.pdf)
3. Rapporto struttura
- funzione di proteine: l'esempio dei
Virus (virus.pdf)
4. Interazione onde elettromagnetiche - materia (scattering.pdf
scattering_riassunto.pdf)
5. Transizioni elettroniche e assorbimento (assorbimento.pdf)
6. Espressione
e purificazione di
proteine ricombinanti (purificazione.pdf)
7. Strutture
quaternarie e caratteristiche
strutturali
a bassa risoluzione: dynamic light scattering (DLS)
e small
angle
X ray diffraction scattering (SAXS) (dls.pdf,
saxs.pdf)
8.
Cristallografia di proteine:
cristallogenesi (cristallizzazione.pdf)
9. Simmetrie
nei cristalli, gruppi
puntuali e gruppi spaziali (simmetrie.pdf)
10.
Esperimento di diffrazione e raccolta
dati (diffrazione.pdf)
11. Problema
della fase e tecniche di
fasatura:
molecular replacement, multiple isomorfous replacement,
multiple
anomalous diffraction (mr.pdf,
mir.pdf,
mad.pdf)
12.
Raffinamento e validazione delle
strutture (raffinamento.pdf)
13. Spettroscopia infrarossa e fluorescenza (infrarosso.pdf,
fluorescence.pdf)
14. Nuclear Magnetic Resonance (nmr.pdf)
Testi
consigliati:
per approfondire
gli argomenti proposti si consigliano i testi
seguenti:
parte relativa
alla struttura delle proteine:
1. Petsko, G.,
Ringe, D. Struttura e
Funzione delle Proteine (Zanichelli, 2005)
2. Branden, C., Tooze,
J. Introduzione
alla Struttura delle Proteine (II ed., Zanichelli, 2001)
Diversi testi di
Biochimica trattano estesamente, in genere nella parte
iniziale del trattato, di principi base della struttura delle proteine.
Tra questi:
Voet, D.
& Voet, J.
“Biochemistry” 2nd - 3rd editions (la
seconda Edizione e’ tradotta in Italiano)
parte relativa
ai virus:
1. J.H. Strauss,
E.G. Strauss, Viruses, Academic Press.
2. S.J. Flint,
L.W. Enquist, V.R. Racaniello, A. M. Skalka. Principles
of Virology, ASM Press.
metodi biofisici
(tra cui l'assorbimento):
1. Serdyuk, Zaccai R. & Zaccai J. Methods in molecular biophysics.
Cambridge 2007
2. Cantor R.C.
& Schimmel P.R. Biophysical Chemistry (Part II),
1980.
3. Berne J.
& Pecora R. Dynamic Light Scattering, Dover 2000.
4. Campbell I.D. & Raymond A.D. Biological Spectroscopy, 1984.
simmetrie e
gruppi puntuali:
1. Harris D.C.
& Bertolucci M.D. Symmetry and Spectroscopy.
Dover 1978.
diffrazione e
SAXS.:
1. Guinier A. X-Ray Diffraction: In Crystals, Imperfect Crystals, and
Amorphous Bodies. Dover 1994.
2. Kasai N.
& Kakudo M. X-Ray Diffraction by Macromolecules
(Springer)
per la
trattazione della parte di diffrazione X da parte di cristalli
macromolecolari biologici, esistono diversi testi. Tra i piu’
aggiornati e completi sono:
1.
Drenth, J., Principles of Protein
X-ray Crystallography (2002, Springer)
2.
Giacovazzo et al. Fundamentals of
Crystallography (Oxford Univ. Press, 2002)