Questa evoluzione nel rapporto monaco / corpo si riflette anche nell'atteggiamento verso la medicina: dagli infirmari monastici dove il frate malato viene ricoverato per il tempo che basta perché possa tornare a pregare e a lavorare, si passa gradatamente ad una apertura verso il mondo ed i malati laici: nei secolo XII e XIII si assiste all'istituzione degli Ordini Ospedalieri, modellati sulla Regola di S. Agostino. Contemporaneamente si assiste ad una diffusa fondazione in Europa di ospedali e lebbrosari con il compito dapprima dell'assistenza, ma successivamente anche della cura dei pellegrini e degli ammalati.
Il lavoro di copiatura, negli scriptoria dei monasteri dei testi medici dell'antichità classica, soprattutto dei trattati di terapia, metteva a disposizione dei monaci un bagaglio terapeutico consolidato ed efficace. La dietetica antica venne adattata alle regole spirituali dei monaci, ma mantenne la sua autorità, come ci testimonia la Regola di S. Benedetto, che permetteva ai malati l'uso dei bagni e della carne e addirittura una cucina apposita per preparare i pasti agli ammalati.