Mille anni fa, i quattro maghi più famosi dell’epoca, Godric Grifondoro, Tosca Tassorosso, Cosetta Corvonero e Salazar Serpeverde, decisero di fondare una scuola: costruirono un castello ben lontano dagli occhi dei babbani poiché in quegli anni maghi e streghe erano continuamente perseguitati.

Inizialmente i fondatori lavorarono in armonia, cercando giovani che possedevano doti magiche. Ma poi tra loro nacquero dei disaccordi: Salazar Serpeverde voleva selezionare con maggior severità gli studenti della scuola; era convinto infatti che il sapere magico dovesse essere custodito dalle famiglie di soli maghi, gli studenti mezzosangue (nati da babbani) erano per Serpeverde inaffidabili.

Salazar allora costruì nel castello la "Camera dei Segreti", una stanza segreta di cui gli altri fondatori ignoravano l’esistenza. Prima di lasciare il castello, la sigillò in modo che nessuno avrebbe potuto aprirla eccetto il suo erede. Aprendo la camera si sarebbe liberato un mostro, un Basilisco, che avrebbe purificato la scuola da coloro che, almeno secondo Serpeverde, non erano degni di frequentarla.

Oltre ai dormitori degli studenti, le aule, i sotterranei, i corridoi, le sale e gli uffici dei professori, esiste nella scuola una stanza molto speciale, chiamata la "Stanza delle Necessità". Compare dopo che si passa davanti al muro per tre volte  pensando intensamente a quello che si desidera, e dentro si può trovare tutto quello che serve in quel momento. E' utilizzata da Harry e i suoi compagni per le Esercitazioni Segrete.