Ganondorf è un bieco stregone proveniente dalla Valle dei Gerudo pronto a tutto pur di impossessarsi della Triforza e divenire quindi padrone del mondo. Che sia un personaggio particolare lo dice anche la sua storia: infatti, la tribù dei Gerudo, notoriamente composta da sole donne come le Amazzoni, partorisce un figlio ogni 100 anni. Inutile dire che è stato lui l'ultimo bambino nato dalla popolazione dei ladri del deserto. Sua madre, Naboruru, tra l'altro appartenente ai 7 Saggi del Sacro Reame (assieme a Darunia, Ruto, Saria, Impa, Zelda e l'Antico Fondatore di Hyrule), capì di portare in grembo l'uomo che avrebbe messo in pericolo l'equilibro di Hyrule ma, per amore materno, non riuscì a denunciare agli altri saggi la questione e portò avanti la gravidanza in segreto. Di questo Ganondorf gliene è grato: difatti Noboruru, quando si scontrò con suo figlio, non fu eliminata da questi ma semplicemente rinchiusa all'interno del Tempio di Colossus, diventando così l'unico avversario di Ganondorf ancora in grado di poter raccontare ai posteri del suo scontro.
Dopo essersi ingraziato il Re di Hyrule, Ganondorf riuscì ad impadronirsi di un pezzo della Triforza, quello del Potere (quello della Saggezza lo detiene Zelda, quello del Coraggio Link) guadagnando così un potere immenso che lo tramutò in quell'essere che tutti i Link della storia successiva (Ocarina del Tempo è infatti da posizionarsi all'inizio della saga) impareranno a conoscere e a detestare: Ganon!

Curiosità: Perché Ganon ha un aspetto suiniforme? Da quando i maiali possono raffigurare il Grande Re del Male!? Misteri di Miyamoto…

Giochi in cui ha tentato di impossessarsi del Regno di Hyrule: The Legend Of Zelda (1986), A Link To The Past, Link's Awakening, Oracle Of Ages, Oracle Of Seasons, Ocarina Of Time, Wind Waker e SSB.M.