Il concetto di metabole altro non è che il passaggio da un tono all’altro nella stessa composizione.
Viene essenzialmente negato il primo postulato dell’ipersistema.

Un tipico esempio di metabole è il sol # della toccata IV dal I libro. Può infatti essere pensato come la sfumatura Lidia del tono di re in cui è impostato il passaggio.

Questa teoria non riesce però a dare spiegazioni convincenti per alcune note estranee, soprattutto quelle presenti nei passaggi cromatici.

Per esempio, nella Toccata XI del primo libro il sol # e il do # che compaiono alla fine del brano non trovano giustificazione, in quanto tutto il passaggio finale è imperniato sul tono di do.