Il monastero fu fondato durante la prima metà del Trecento da alcune monache provenienti da una fondazione benedettina esistente in località Sala. Il complesso religioso crebbe lentamente sino a che non fu costruita nel 1584 la chiesa secondo il progetto di Leonardo Marcacci. Attualmente il complesso monastico ospita alcuni istituti scolastici, tra i quali il Liceo Classico Forteguerri, che qui ha trovato sede dopo che i locali di Piazza della Sapienza sono stati destinati ad accogliere la Biblioteca Forteguerriana. Le monache benedettine furono accolte nel vicino Monastero di S.Michele.