Nella terza area dell'orto la vegetazione è stata lasciata in condizioni di spontaneità perchè importante sotto il profilo scientifico e meritevole di tutela.
Ha una superficie di circa 11000 m², caratterizzata dalla presenza di due specie: il Giunco nero(Schoenus nigricans, da cui ha preso il nome la Cooperativa che ha in gestione l'orto, e l'Afillante(Aphyllanthes monspeliensis). L'Afillante è un giglio azzurrino privo di foglie e la sua distribuzione in Italia è limitata all Riviera di Ponente, dove raggiunge l'estremo orientale proprio a Cogoleto, e a poche altre località dell'Appennino e del Bresciano.