Note sulla prima versione: Nel caso in cui la versione vecchia del filtro sembri non funzionare, si può procedere in questo modo: andare nella cartella dove è stato installato l'AC3Filters (di solito C:\programmi) e copiare i file mpegaudio.ax e iviaudio.ax nella cartella di sistema (system o system 32, rispettivamente per 9x/ME, NT/ 2000/XP), quindi esegire i file .bat relativi al proprio sistema operativo e riavviare il sistema. Sui vecchi Windows NT questo AC3 Filter potrebbe non funzionare.

Note sulla nuova versione: Le nuove versioni dell' AC3 Filter, dalla 0.63 b in poi, possiedono un complesso pannello di configurazione raggiungibile tramite la voce di menù "Start\Programmi\AC3 Filter\AC3 Filter Config". E' consigliabile lasciare la maggior parte delle opzioni sui valori che troviamo di default, tuttavia è possibile modificare le voci relative all'output, che riguardano il numero degli altoparlanti, le decodifiche dolby e l'uscita SPDIF.