Fino alla prima metà degli anni '90 i due sistemi non erano in concorrenza tra loro in quanto i sistemi Unix erano specializzati a fare i server mentre i sistemi Windows facevano i clients o le work station.
Nella seconda metà degli anni '90 le cose cambiano in quanto la Microsoft inpone nel mercato il suo server Windows NT 4.0.
Nonostante il prodotto come server non sia neanche lontanamente paragonabile con prodotti tipo SCO Unix, Sun Solaris, BSD e Linux riesce ad imporsi sul mercato grazie ad una enorme pressione commerciale che usava come arma di convincimento la potenza del monopolio Microsoft.
Nel frattempo gli sviluppatori degli ambienti Unix non erano stati a guardare ed avevano sviluppato degli ambienti di interfaccia grafica.
La concorrenza tra i due tipi di ambiente oramai è totale; Windows non è più solo client e Unix non è più solo server.
La concorrenza tra i due tipi di ambiente ha dei riflessi importanti proprio nei posti di lavoro, dove iniziano a formarsi le fazioni che sostengono i due tipi di ambiente.
La differenza tra le due fazioni non è solo quella di una scelta commerciale, è anche una scelta filosofica.
I sostenitori degli ambienti Microsoft sono convinti che tale azienda riuscirà a controllare l'intero software mondiale perché il loro software è il più usato e può sfoggiare prodotti di grande qualità come "Internet Explorer" e "Office"; ma è la potenza commerciale la cosa che fa veramente la differenza.
I sostenitori degli ambienti Unix hanno generalmente più propensione tecnologica e fanno notare l'evidente differenza di prestazioni tra i sistemi Unix e i sistemi Windows. L'altra grande differenza a favore dei sistemi Unix è la grande quantità di software Open Source.
Il software Open Source offre il vantaggio di essere gratuito e di rendere disponibili i codici sorgenti.
Avere a disposizione i sorgenti significa poter capire i motivi perché qualcosa non funziona semplicemente capendo come funziona senza doversi ridurre all'unica medicina possibile dei sistemi windows che è il reboot.
In oltre non è vero che sui sistemi Unix non si può fare office automation in quanto il GAP a favore di Windows è stato ormai colmato grazie a prodotti come Star Office che sono in grado di sostituire in tutto e per tutto MS-Office potendo anche eleborare files nel formato di quest'ultimo.