La YellowDog Linux include anche alcune utilità di boot (yaboot, XBoot, quik) che sono utili specialmente se sul vostro hard-disk convivono più sistemi operativi.
In realtà questi tools sono utili per lo più a chi ha installato sull'hard-disk MacOS e Linux e vuole la possibilità di selezionare all'accensione del computer quale sistema operativo avviare.
BootX richiede MacOS. yaboot non funziona con l'IBM RS/6000 43P 7248 Model 132. Quik/installquik supporta i computer IBM RS/6000 CHRP, il modello 43P 7248 133 è però PReP e ha dei problemi.