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Nelle elezioni politiche del 2013, che si svolgeranno il 24 e 25 febbraio 2013, il partito fa parte della coalizione Italia. Bene Comune, che sostiene come candidato premier Pier Luigi Bersani. Sel nelle proprie liste ospiterà esponenti dei Verdi del Sudtirolo/Alto Adige che a differenza dei Verdi italiani hanno deciso di sostenere la coalizione di centrosinistra.
Il segretario Nichi Vendola ha per lungo tempo cercato di indurre il Pd ad accettare nell'alleanza anche l'Italia dei Valori; ma dopo l'assoluto rifiuto dei democratici Sel ha deciso di restare col partito che consentiva di un rientro in Parlamento dopo la debacle del 2008 (quando si presentava nella Sinistra Arcobaleno). Tuttavia Vendola non rinuncia ogni tanto a fare di dichiarazioni di conciliazione nei confronti del partito di Di Pietro, ma il Pd resta della sua opinione.
Gli ultimi sondaggi consentiti accreditano il partito al 4,5%.