Come sono composti gli acidi nucleici

Ci sono due tipi di acidi nucleici, l'acido desossiribonucleico (DNA) e l'acido Ribonucleico(RNA). Entrambi sono degli eteropolimeri.
I monomeri del DNA si chiamano desossiribonucleotidi mentre quelli dell'RNA si chiamano ribonucleotidi, a seconda dello zucchero in esso presente. Entrambi sono costituiti dei seguenti tre gruppi.

Basi
Il primo costituente sono le basi azotate puriniche e pirimidiniche di Watson e Creek. Le basi puriniche adenosina e guanina si ritrovano sia nel DNA che RNA, mentre delle pirimidiniche Citosina e Timina stanno nel DNA e nell' RNA Citosia e Uranile.

Zuccheri.

Il DNA contiene il D-2 desossiribosio, mentre RNA contiene il D ribosio

Gruppi Fosfato.

Si trovano in genere sotto forma di fosfato diestere legati al Carbonio 5' del ribosio o del desossiribosio

Nel DNA, le basi sono legate al 2'desossiribosio con un legame N1'glucosidico a formare un desossinucleoside, mentre nell' RNA, le basi sono legate al ribosio per formare un nucleoside con un legame N1'glicosidico

I desossiriibonucleotidi sono degli esteri fostorici in posizione 5' dei desossinucleosidi

Gli acidi nucleici sono polimeri dei fosfati dei nucleotidi.

I polimeri DNA e RNA sono formati da legami fosfodiestere tra gli OH 5' di un nucleotide e il 3' di un idrossile seguente. I nucleotidi sono acidi forti in quanto i due pKa del fosfodiestere sono tra 0.7 ed 1 e 6.1 e 6.3. Di conseguenza lo scheletro dell'RNA e DNA sono normalmente carichi negativamente. Le basi assorbono attorno a 260 nm. I legami fosfodiesteri sono termodinamicamente instabili in quanto il DG di idrolisi è circa -25 kJ/mol, ma, a causa della cinetica molto lenta, in mancanza di un enzima o di un catalizzatore i polimeri non si idrolizzano

Struttura primaria degli acidi nucleici

Come per le proteine, gli acidi nucleici hanno una struttura primaria, costituita dalla sequenza di basi e una direzionalità con una estremità 5' libera da un lato ed una 3' libera dall'altro. Per convenzione le sequenze degli acidi nucleici sono scritte a partire dalla 5' finendo alla 3'. Secondo questa convenzione i legami fosfodiesteri vanno dal 3' al 5'