La piu' influente fonte segreta di Mulder e' stata presentata nel secondo episodio della serie durante il quale appare improvvisamente per avvertire l'agente di stare alla larga da un caso.
Nelle sue apparizioni successive ha ripetuto simili avvertimenti, mentre al tempo stesso forniva a Mulder informazioni per aiutarlo nelle sue indagini. Sempre criptico, una volta ha ammesso apertamente di aver mentito al suo protetto. E' entrato in scena per salvare il lavoro di Mulder, e ha salvato la vita di Mulder a prezzo della propria. Era un uomo intrappolato tra due forze contrastanti. Se da un lato dichiarava di avere una posizione tanto alta da poter procurare a Mulder posti a sedere in ogni stadio di baseball della nazione, ha confessato di mettere a repentaglio la vita a ogni loro incontro. Ha detto di aver lavorato per la CIA nel Vietnam e di appartenere a un'organizzazione che si e' macchiata di orribili crimini contro l'umanita'.
Il suo scopo sembra proprio quello di distruggere quest'organizzazione per mezzo di Mulder e Scully. La sua influenza su Mulder e sugli X-Files e' stata molto profonda.

Tanto che egli riappare in Amor Fati, durante la fase onirica di Mulder e si scopre quanto il suo assassinio sia pesato sulla coscienza dell'agente.

Deep Throat e' interpretato da Jerry Hardin

Deep Throat compare in: Deep Throat, Ghost in the Machine, Fallen Angel, Eve, Young at Heart, E.B.E, The Erlenmeyer Flask, The Blessing Way, Talitha Cumi, Musing of a Cigarette Smoking Man, Amor Fati.