Nel 1946 J. Edgar Hoover apre il primissimo caso di Fenomeni Inspiegabili, che riguarda la licantropia. Durante la Seconda Guerra Mondiale nel Nord-ovest si riscontra una serie di assassini, inclusi sette nel Browning, Montana. Ogni vittima è ridotta a brandelli e mangiata, come da un animale selvatico. Molte delle vittime, comunque, sono state ritrovate a casa, come se avessero invitato il loro assassino nelle loro case. Nel Glacier National Park, le autorità circondano una baita che credono contenga l'animale. Loro sparano sulla baita, ma quando entrano nella baita per recuperare l'animale morto trovano solo il corpo di Richard Watkins. Gli assassinii si fermano. Hoover chiude a chiave i casi negli X-Files, perché sono insoluti. Un ragazzo indiano Trego di 16 anni di nome Ish vede per un attimo l'animale trasformarsi vicino alla casa di Watkin e crede che sia un lupo mannaro.

vedi episodio 1x18 Shapes

    Sempre nel 1944 I casi di Fenomeni Inspiegabili vengono inizialmente catalogati sotto la "U" nell'ufficio dell'FBI di Washington DC. Verranno spostati più tardi nel più ampio cassetto della "X" e saranno poi noti come "X-Files."

vedi episodio 5x15 Travelers

    Nel 1946, Walter Chaco si stabilisce a Dudley, Arkansas, e comincia a costruire una fabbrica per la lavorazione del pollo che diviene la principale fonte di lavoro della comunità. Lentamente comincia ad insegnare ai suoi vicini di casa quello che ha imparato in Nouva Guinea per prolungare la vita tramite il cannibalismo.

vedi episodio 2x24 Our Town

    Il 3 dicembre 1946, nasce il primo bambino di Bert e Loretta Barry a Greensboro, NC. Il ragazzo, che diverrà da grande un agente dell'FBI, viene chiamato Duane.

vedi episodio 2x05 Duane Barry

    Dal 29 giugno al 2 luglio del 1947, uno dei due fratelli di nome Arthur Dales (non quello nell'FBI negli anni 50) è un poliziotto presso Roswell, NM, e viene assegnato alla protezione della star nera del baseball Josh Exley da minacce razziste che vogliono che il gioco del baseball sia tenuto bianco. Exley gioca per una squadra interamente di neri di nome i Grigi di Roswell. Dales finisce per viaggiare sull'autobus della squadra, e di notte, durante una tempesta con dei lampi, il riflesso di Exley sul finestrino dell'autobus appare essere l'immagine di un alieno grigio. Il giorno successivo, durante un gioco, Exley viene colpito alla testa con una palla e messo fuori combattimento. Mormora delle parole in una lingua ignota ed afferma di essere di Macon, Georgia. Dales trova dell'acido verde sul guanto usato come cuscino per la testa di Exley e lo spedisce per essere esaminato. Dales chiama la polizia di Macon e viene a sapere che Josh Exley era un bambino di sei anni che è scomparso circa nel periodo in cui Exley è arrivato a Roswell. Il poliziotto di Macon con cui ha parlato Dales è in realtà un cacciatore di taglie alieno. Exley nega a Dales di essere mai stato a Macon. Dales pensa che Exley sabotato il gioco quel giorno perché gli esploratori della American League erano là e non voleva essere arruolato nelle leghe professioniste, perché Exley ha un segreto.

maggiori informazioni nell'episodio6x20 Unnatural

    4 luglio, 1947. Il presunto impatto di un ufo a Roswell nel New Messico, è accaduto circa in questa data. L' 8 luglio viene rilascita dalla Base dell'Areonautica di Roswell la notizia che affermava che era stato recuperato un "disco" precipitato. Il giorno seguente, comunque, un altro rilascio di notizie affermava che in realtà erano i resti di un pallore metereologico. Testimoni oculari riportano che nella zona più tardi atterrarono o precipitarono almeno tre UFO nel Nuovo Messico circa nello stesso periodo - uno proprio a nord di Roswell, uno a 75 miglia a nord-ovest ed uno a 175 miglia a ovest.

Dato storico

    In Requiem, l'Uomo che Fuma menziona "Roswell e Corona." "Corona" potrebbe essere un nome in codice di un progetto segreto condotto nell'area di Roswell. "Corona" è stato descritto dal governo degli Stati Uniti come il primo esperimento di ricognizione satellitare, per il quale molti componenti sono stati testati su palloni eorostatici d'alta quota. I palloni d'alta quota sono spesso considerati dei teorici degli UFO come copertura per incidenti UFO.
    Gola Profonda più tardi dice che il DNA alieno è stato ottenuto per la prima volta nel 1947, ma che Roswell era una cortina di fumo, e che una mezza dozzina di esemplari migliora sono stati ottenuti tra il 1947 ed il 1994.

vedi episodio 1x23 The Erlenmeyer Flask

    Come conseguenza di qualsiasi cosa sia accaduta a Roswell, parte un progetto governativo segreto all'interno del Dipartimento di Stato per indagare e studiare gli alieni. Il Progetto è composto da scienziati tedeschi che hanno ottenuto l'immunità dai crimini di guerra e gli è stato concesso di continuare gli esperimenti eugenetici del Terzo Reich. Anche gli scienziati giapponesi partecipano al lavoro.

vedi episodio 2x25 Anasazi

    I primi esperimenti degli scienziati erano apparentemente immorali, causando ai soggetti umani gradi deformazioni. Infine queste prime vitiime, note come "La Merce", vengono uccise con del gas ed i loro corpi lasciati in un vagone ferroviario frigonifero, seppellito in un avvallamento della riserva Navaho. Victor Klemper è uno degli scienziati tedeschi coinvolti in questo lavoro.

vedi episodio 2x19 Dod Kalm

Gola profonda afferma che nel 1947 c'è stata una riunione super-segreta dei rappresentanti di molte nazioni per accordarsi che tutti i sopravvissuti degli incidenti UFO sarànno sterminato. In un'altro momento, dice che quest'ordine proveniva dalla Risoluzione 1013 del Consiglio di Sicurezza. Alla luce di ulteriori rivelazioni sul fatto che gli alieni in realtà sono Colonizzatori, intenzionati a sterminare la razza umana, questo accordo/ordine acquista un senso.