Mulder e Doggett si trovano controvoglia ad indagare assieme su delle morti a bordo di una piattaforma petrolifera. Ma Mulder è convinto che la piattaforma contenga in realtà l'olio nero alieno.

Riassunto:
      Sulla piattaforma petrolifera Orpheus della Galpex Petroleum situata nel Golfo del Messico, l'equipaggio sta cenando davanti alla televisione. Loro non notano l'operaio messicano Simon De La Cruz rubare un coltello dalla cucina. Si introduce nella sala comunicazioni della piattaforma e pugnala l'ingegnere. Quando la televisione perde il segnale nella confusa sala, il capo Bo Taylor va nella sala comunicazioni e trova De La Cruz che distrugge tutto l'equipaggiamento della radio. Nota che gli occhi dell'ingegnere a terra sono pieni dell'olio nero alieno. "Ti sei fregato," dice Bo. La sua faccia si illumina di un accecante luce bianca che si espande all'intero suo corpo. Simon grida in spagnolo.
      All'FBI, Doggett trova Mulder che fruga nell'archivio degli X-file. Benchè non sia da tempo assegnato all'ufficio, Mulder crede che una recente morte di un operaio di una piattaforma petrolifera esposto alle radiazioni sia collegabile agli extraterrestri. Scully chiama Doggett per ricordargli che lo sta aspettando assieme a Kersh e ad un dirigente della Galpex Petroleum, che è venuto dopo essere stato contattato da Mulder. Kersh manda Doggett sulla piattaforma. Quando arriva, Doggett è adirato nel vedere che Mulder è già là. A Washington l'autopsia di Scully su Simon mostra che è stato infettato dall'olio nero, ma che il suo corpo aveva una sorta di immunità. Dice a Skinner che devono far evacuare la piattaforma per l'incolumità di Doggett, temendo che altri potrebbero venir infettati. Scully mostra il corpo al dirigente della Galpex e gli ordina di chiudere la piattaforma. E' allarmata quando lui decide di portare a terra l'equipaggio della piattaforma. Nel frattempo, un'altro marinaio di nome Yuri nota che la radio sulla piattaforma intercetta una strana frequenza. Bo attacca Yuri e fa colare l'olio nero su di lui.
      Scully cerca di contattare via radio Doggett sulla piattaforma e rimane sorpresa quando risponde Mulder. Doggett ordina la quarantena per un possibile contagio, e Mulder nota che manca un uomo dalla lista della nave. Mentre Mulder e Doggett escono per cercare quest'uomo, Diego Garza, Doggett tenta di riprendere il controllo delle indagini, e chiede di sapere ciò che l'equipaggio starebbe preoteggendo. Mulder ammette di avere visto l'olio nero alieno. Crede inoltre che il dirigente della Galpex mentisse all'FBI dato che l'equipaggio della piattaforma ha già estratto il petrolio che apparentemente cercava. Improvvisamente, scatta un allarme e gli agenti vedono un incendio nella sala comunicazioni. Mulder si imbatte per caso nei resti di una molotov nella sala, ed è convinto che il fuoco sia stato appiccato di proposito. Doggett corre a cercare un altro estintore e viene colpito sulla testa dal nascosto Diego Garza. Garza ferisce al braccio Doggett ed è sollevato nel vedere che il sangue dell'agente è veramente rosso. Dice a Doggett in spagnolo che le "navi volanti" stanno arrivando.
      Malgrado le dichiarazioni di Scully, Kersh ordina che la quarantena sia tolta appena sarà ripristinata la comunicazione radio. Dalla sua autopsia, Scully comprende che le origini indiano-messicane di De La Cruz lo hanno reso immune al virus alieno. L'equipaggio probabilmente lo ha irradiato perché sapeva qualcosa, e perchè non potevano controllarlo.
      Doggett convince Garza che può aiutarlo a lasciare la piattaforma senza che l'equipaggio lo scopra. Bo, per conto suo, cerca Garza, e attacca Doggett. Il capo sta per infettare Doggett con l'olio nero alieno quando Mulder lo salva. Gli agenti si rinchiudono nella sala comunicazioni e cercano di aggiustare la radio mentre l'equipaggio infettato dall'olio nero cerca di sfondare la porta. Mulder li tiene lontani, e Doggett in qualche modo aggiusta la radio. Scully attende dall'altro capo della radio per dir loro che gli elicotteri stanno arrivando. Doggett dice che lui, Mulder e Garza sono i soli a non essere infetti, quindi l'elicottero non dovrà sbarcare sulla piattaforma. Improvvisamente, Mulder distrugge la radio. Doggett non è certo se anche lui sia infetto, ma Mulder spiega che la radio in realtà funziona da contatto con la nave madre. Misteriosamente, l'equipaggio smette di colpire la porta. Doggett risale a cercare Garza dopo che ha promesso alll'uomo che lo avrebbe aiutato. Garza è morto, ucciso dalle radiazioni. L'equipaggio comincia a demolire la piattaforma, e Mulder e Doggett corrono per sfuggire alle fiamme. Gli agenti arrivano su un lato della piattaforma e vedono l'elicottero in lontananza. Il pilota gli dice qualcosa, e pensano che gli abbia detto di saltare. Mentre la piattaforma esplode, Mulder e Doggett saltano in acqua.
      A Washington, Mulder è nell'ufficio degli X-files quando entra Doggett. La Galpex ha perso la concessione di trivellazione, e Doggett si prepara a prendersi la responsabilità per la mala gestione del caso. Mulder però gli dice che è stato licenziato dall'FBI, prendendosi lui la colpa, e lo ha fatto sia per Doggett che per gli X-files. " Tu hai visto," dice Mulder, spingendo Doggett a prevenire ogni ulteriore perforazione. Mentre sulla piattaforma, Doggett cecava di allontanare Mulder dal caso, ora cerca di convincerlo a restare. Mulder lascia l'ufficio, dicendo a Doggett "sei tu alla guida qui, ora."